AMM 2 an der Universität Wien

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Replicative cycle of HPV?

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Togavirus

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Uniqueness of retrovirus

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Mechanism Retonavir

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Rhabdovirus

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Retrovirus family

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N P M G L
on Rhabdoviruses

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Measles Virus

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Flavivirus

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Influenza A

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Influenza A Problems and solution

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AMM 2



Replicative cycle of HPV?

Attatchment and entry -> HPV infects basal stem cells under skin and mucosal surfaces. Binds to unkown cellular molecule to enter the cell. DNA delivered to nucleus. HPV DNA remains episomal (not integrated into host genome). 
Gene expression and replication -> only some HPV genes expressed, no production of virus particles. when stem cells differentiate to keratinocytes all genes are expressed and viral particles produced.

Assembly and release -> release occures without cell lysis

AMM 2

Togavirus

  • SS RNA, + sense
  • 5' cap, 3' PolyA
  • Enveloped, icosahedral
  • 2 ORFs
  • 5' region non-structural
  • replication & release in cytoplasm
  • proteolytic processing
  • 5' proteins cleaved by viral protease, 3' cleaved by part of capsid & by cellular proteases
  • glycosylation of envelope protein in the ER
  • semlici forrest, sindbis, rubella

AMM 2

Uniqueness of retrovirus

  • 2 copies of RNA "diploid"
  • only +sense RNA not immediately translated into protein
  • only viral RNA which requires tRNA
  • Only viral RNA genome synthesized by cellular RNA polymerase

AMM 2



Mechanism Retonavir

Inhibits HIV Protease. Prevents maturation of particle. praticle can't be infectuous. always in combination with 2 other medications.

AMM 2


Rhabdovirus

  • SS RNA, - sense
  • Enveloped, helical
  • 5 genes and non-coding leader
  • Contains viral RNA polymerase. 
  • RNA copied into +sense subgenomic RNAs on release into cytoplasm. More mRNAs corresponding to 3'end are synthesised -> Transcriptional polarity
  • Rabies, Vesicular stomatits virus(VSV) (Farm animals)

AMM 2



Retrovirus family

  • Enveloped icosahedral
  • ss RNA, +sense
  • cellular tRNA
  • 2 copies of genomic RNA
  • RNA bound to nucleocapsid protein
  • env gene product cleaved during maturation into transmembrane domain (TM - contains fusion peptide) and surface domain (SU - binds to cellular receptor)
  • Members: avian leukosis virus (ALV), HIV type 1, Human t-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1)

AMM 2



N P M G L
on Rhabdoviruses

N... Nucelocapsid Protein

P&L... RNA Polymerase

M... Matrix

G... Surface Glycoprotein

AMM 2


Measles Virus

  • Paramyxus, SS RNA, -sense
  • Enveloped, icoosahedral
  • RNA polymerase makes +sense subgenomic copies -> encoding mature proteins.
  • mRNAs -> 5'cap & 3'PolyA
  • Transcriptional polarity
  • Glycosylation of envelope protein
  • Transmission via respiratory droplets

AMM 2

Flavivirus

  • SS RNA, + sense
  • 5' cap, structural
  • enveloped, icosahedral
  • 1 ORF
  • replication in cytoplasm
  • proteolytic processing
  • glycosylate proteins in ER
  • 1 single protein, cleaved by cellular & viral proteases
  • Hepatitis C, yellow fever, tick-borne encephalitis

AMM 2



Influenza A

  • Orthomyxovirus, Segmented ss RNA, -Sense
  • 8 genome Segments
  • Enveloped, helical
  • Haemagglutinin (HA) binds to sialic acid of glycoproteins (GP) on cell surface & induces fusion of endosomal & viral membrane.
  • neuraminidase (NA) cleaves sialic acid from viral & cellular GPs. Allows virus to be released from infected cells.
  • viral synthesis in nucleus, segments are copied into subgenomic +mRNAs & new genomic -RNAs

AMM 2



Influenza A Problems and solution

Problems: Virus particle outside the cell, but synthesis takes place in the nucleus.

Solution: HA binds to sialic acid  of cell surface GPs. -> complex internalised into endosome -> H+ pumped into endosome -> pH sinks to pH 5 -> HA undergoes massive structural rearrangements -> fusion peptide of HA inserts into endosomal membrane. H+ pumped into viral interior -> gene segments freed from matrix protein M1. Viral and endosomal membranes fuse. Nuclear localisation signals enable transport of RNA-protein complex into nucleus

AMM 2



Poliovirus life-cycle

  • Picornavirus with 2 UTRs (untranslated regions)

RNA genome linked to Vpg. On entry, cellular Ribosomes translate RNA into a single Polyprotein. Cleaved by virally encoded proteases to mature proteins, including the viral RNA-Polymerase. Vpg primes viral RNA polymerase to synthesize -RNA -> ds RNA intermediate -> +sense copies

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