ZV Molekularbiologie an der Universität Heidelberg

Karteikarten und Zusammenfassungen für ZV Molekularbiologie an der Universität Heidelberg

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NES

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mRNA Export

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prokaryontische mRNA

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eukaryotische mRNA

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mRNA Abbau

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Pan2-Pan3

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Ccr4-Caf1-Not

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Dcp2

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Nudt16

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optimale Codons

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ZV Molekularbiologie

NES

markiert cargo-Protein

Export Signal

bindet an exportin 1

ZV Molekularbiologie

mRNA Export

  1. Capping, Bindung desCBP20-80 Komplexes
  2. THO-Komplex bindet, wichtig für Transkriptionselongation, verhindert Bindung von RNA/DNA
  3. Bindung RNA-helicase UAP56
  4. Bindung von Adapterproteinen ALY und SR
  5. Adaptor Proteine binden an Export Rezeptor NXF1
  6. NXF1 interagiert mit Kernpore
  7. Translokation
  8. Auflösung des Transportkomplex auf anderer Seite mit Hilfe von Helikase

ZV Molekularbiologie

prokaryontische mRNA

5'Ende: Triphosphat

3'Ende: Stemloop bei RHo abhängiger Translation

polycistronisch

Shine-Dalgarno Sequenz


ZV Molekularbiologie

eukaryotische mRNA

5'ende: Methyl-Guanosin Cap

3'Ende: PolyA-Schwanz

Intronhaltig

fast helixförmige Struktur

monocistronisch

Initiation durch eIF4A/E/G

ZV Molekularbiologie

mRNA Abbau

  1. Deadenylierung
  2. bei kritischer Deadenylierung verlust der Kappe
  3. freies 5'Ende ist Signal für Exonukleasen

ZV Molekularbiologie

Pan2-Pan3

langsame Deadenylierung langer Schwänze

distributive Deadenylase

ZV Molekularbiologie

Ccr4-Caf1-Not

wird aktiviert wenn durch Pan eine kritische Größe abgebaut wird

schneller Abbau kurzer Schwänze

prozessive Deadenylase

ZV Molekularbiologie

Dcp2

Decapping Enzym mit Nudix-domäne

Teil eines Komplexes

viele Aktivatoren

ZV Molekularbiologie

Nudt16

Decapping Enzym mit Nudix-Domäne

ZV Molekularbiologie

optimale Codons

entsprechen T-RNAs die häufig vorkommen

hohe Affinität für Ribosom und passendes Codon

effiziente Translation da gute Bindung und schnelle Translation

ZV Molekularbiologie

AU reiche elemente

in 3' untranslatierter Region viler kurzlebiger RNAs

verhindern Überpoduktion

werden von TTP erkannt 

ZV Molekularbiologie

TTP

löst deadenylierung über Caf1-Not Komplex aus

wird durch Phosphorylierung gehemmt

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