Bioinfo an der Universität Heidelberg

Karteikarten und Zusammenfassungen für Bioinfo an der Universität Heidelberg

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Erläutere Barplots

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Welche Information geht durch Boxplots über die numerischen Daten verloren?

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Womit kann die Streuung der Daten beschrieben werden?

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Wie berechnet man Median absolute deviation?

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Wann identifiziert k-means cluster?

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Welche Linkage methoden gibt es beim Hirachischen Clustering?

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Welche Wahrscheinlichkeiten kann man mit der Binomial Verteilung berechnen?

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Ist die Binomialverteilung eine diskrete oder kontinuierliche Verteilung?

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Welche Information können wir durch Anwendung der Funktion pbinom(x, size, prob) erhalten?

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Wie kann qbinom angwendet werden? Welche Information braucht es? Welche gibt es aus?

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Berechne mit R:

Probability of getting 5 events out of 5 in a binomial distribution with a probability of 0.5 

UND

# Probability of NOT getting 5 events out of 5 in a binomial distribution with a probability of 0.5

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Erläutere die Negative Binomialverteilung

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Beispielhafte Karteikarten für Bioinfo an der Universität Heidelberg auf StudySmarter:

Bioinfo

Erläutere Barplots

--> Darstelllung kategorischer Daten nach Anzahl

--> Kategorie mit der höchsten Anzahl = Mode

      Bimodale Verteilung --> 2 Modes

--> Skalierung beachten

--> Daten können bei Anzahl, Kategorie usw. geordnet werden

Bioinfo

Welche Information geht durch Boxplots über die numerischen Daten verloren?

--> keine Angabe der Anzahl der Datenpunkte

Bioinfo

Womit kann die Streuung der Daten beschrieben werden?

- Sample Variance

- Standard Deviation

- Interquantile Range (IQR) --> Differenz zwischen 25% und 75% Quantil --> Box enthält 50% der Punkte in Boxplot !!

- Median absolute deviation

Bioinfo

Wie berechnet man Median absolute deviation?

med(|xi -med(x)|)


med: median


( |xi - med(x)| ): abweichung jedes Punktes zum Median aller Punkte berechnen

Bioinfo

Wann identifiziert k-means cluster?

Immer auch wenn es keine gibt im Datensatz

Bioinfo

Welche Linkage methoden gibt es beim Hirachischen Clustering?

Distance between single objects, and object and cluster, and clusters is based on distance measure

-> single-linkage = minimal distance between all elements of A and B

-> complete-linkage= max distance between all elemnts of A and B

-> average Linkage= average of all paiswise distances between elements of A and B

(-> centroid linkage= distance between clusters given by distance of centers

-> ward linkage=distance between 2 clsuters is equal to increase of variance of the combined cluster compared to individual clusters) and others

Bioinfo

Welche Wahrscheinlichkeiten kann man mit der Binomial Verteilung berechnen?

-> Bestimmung der Wahrscheinlichkeit eines Events mit nur 2 möglichen Ereignissen

(Head or Tail, Success or no sucess) in einer Serie von Experimenten

->Die Wahrscheinlichkeit genau 3 Mal Kopf zu haben bei 10 Münzwürfen

Bioinfo

Ist die Binomialverteilung eine diskrete oder kontinuierliche Verteilung?

Diskrete Verteilung

Bioinfo

Welche Information können wir durch Anwendung der Funktion pbinom(x, size, prob) erhalten?

Die kumulative Wahresheinlichkeit für ein Ereignis

Bioinfo

Wie kann qbinom angwendet werden? Welche Information braucht es? Welche gibt es aus?

qbinom(p,size,prob) 

p= Probability for number of sucesses

size= #trials

prob= probability of a sucess


--> gives number of sucesses which matches the cumulative probability


# How many heads will have a probability of 0.25 will come out when a coin
is tossed 51 times.?


Bioinfo

Berechne mit R:

Probability of getting 5 events out of 5 in a binomial distribution with a probability of 0.5 

UND

# Probability of NOT getting 5 events out of 5 in a binomial distribution with a probability of 0.5

dbinom(5,5,0.5)


1-dbinom(5,5,0.5)


--> dbinom(#Ergolge, #Versuche, Wahrscheinlichkeit Erfolg)

Bioinfo

Erläutere die Negative Binomialverteilung

-->Diskrete Wahrscheinlichkeitsverteilung

-> Versuche k unabhängig, und konstante Wahrscheinlichkeit p

-> Wieviele Versuche k bis r Erfolge/der Misserfolge erreicht sind mit einer Erfolgswahrscheinlcihkeit p?

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