Molekulare Zellbiologie an der Universität Bremen

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Caspase3 schneidet:

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Extrinische Apoptose

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Intrinische/ mitochondriale Apoptose

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Purinbasen

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Konformationen der DNA

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Histone

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WSBB der DNA Basen

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Voraussetzungen der PCR

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Unterschiede RNA zu DNA

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RNA Strukturen

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Beispiele RNA Typen

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Phasen der PCR


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Molekulare Zellbiologie

Caspase3 schneidet:

  • Kernskellet -> Spaltung von Laminen (Freilegung der Kernhülle)
  • Aktin -> Cytoskelett
  • ICAD (Inhibitor of caspase-activated DNase)

Molekulare Zellbiologie

Extrinische Apoptose

  • Rezeptor-abhängigen Signalweg (extrazellulare Signale)
  • Aktivierung durch Liganden (Botenstoffe wie Zytokin, TNF, Fasligand) -> binden an Todesrezeptor -> Domänen werden oligomeriiert und durch Initiatorcaspasen geschnitten
  • aktive Caspase aktiviert weitere Caspasen -> Caspase 3 -> löst den Zelltod aus
  • Aktiviert durch:
    • Mangel an Wachstumsfaktoren
    • Strahlungsschäden
    • Tumorzellen
    • Infizierter Zellen

Molekulare Zellbiologie

Intrinische/ mitochondriale Apoptose

  • nach Genomveränderung aktiv
  • Inhalt des Intermembranraum des MT  wird freigelassen
  • Cytochrom C aktiviert Caspase9 -> aktiviert Caspase3
  • Abbau des Zellinneren
  • Normalerweise bindet Bcl-2 Chytochrom C, damit es nicht freigesetzt wird -> Bax-Protein Gegenspieler zu Bcl-2

Molekulare Zellbiologie

Purinbasen

Agenin

Guanin

Molekulare Zellbiologie

Konformationen der DNA

(1) B-DNA: häufigste Konformation, rechtsgängig

(2) A-DNA: experimentelle dehydrierte B-DNA

(3) Z-DNA: linksgängig, sehr selten


Molekulare Zellbiologie

Histone

  • hohen Gehalt an den basischen AS Arginin und Lysin und damit eine hohe
    Affinität zur sauren DNA. 
  • Nucleosom ist ein Histone-Oktamer
  • 147 DNA-Basenpaare (2x rum) gewunden sind

Molekulare Zellbiologie

WSBB der DNA Basen

A-T → 2 WSBB
C-G → 3 WSSB

Molekulare Zellbiologie

Voraussetzungen der PCR

• DNA als Template
• Primer
• Polymerase
• Nukleotide
• Thermocycler (Automatisierung der Temperatur)

Molekulare Zellbiologie

Unterschiede RNA zu DNA

• Ribose statt Desoxyribose
• U statt T
• Verschiedenen Arten von RNA
-> rRNA, tRNA, mRNA, snRNA, microRNA

Molekulare Zellbiologie

RNA Strukturen

  • Duplex (einfache Basenpaarung)
  • Hairpins (oberer Loop ist nicht gepaart)
  • tragen zur Stabilität der RNA bei und
    verhindern einen Abbau durch RNAsen.

Molekulare Zellbiologie

Beispiele RNA Typen

(1) rRNA ->  strukturelle und funktionelle Rolle im
Ribosom, größteil der RNA in der Zelle
(2) mRNA -> messenger RNA nur 5% der gesamten RNA in der Zelle aus.
(3) tmRNA = transfer und messenger RNA

microRNAs (miRNA) sind kurze Stränge, die komplementäre Bindungen mit der mRNA eingehen können.

Molekulare Zellbiologie

Phasen der PCR


1. Denaturierung der dsDNA zu ssDNA
2. Bindung der Oligonukleotiden (Primer) and die ssDNA
3. Polymerase/ Synthese der DNA

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