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Bioinformatik
Bioinformatik
Welche Teilbereiche hat die Genomik?
- Functionalgenomics
- Computationalgenomics
- Epigenomics
- Personal genomics (23 and me, Lifestyle verbesserung)
- Evolutionarygenomics
- Immunomics
- Metagenomics (Interaktion zwischen Spezies z.B. Microorganismen im Darm)
- Pathogenomics
- Psychogenomics
- Genomics of domestication
Bioinformatik
In welchen Teilgebieten hat die Genomik großen Einfluss auf unser Leben
- Saatgut
- Personalisierte Genomik (individuelle Behandlungen)
- NGS
Bioinformatik
Was war Vorraussetzung für die entwicklung von Genomik
die Atomatisierung der Genanalyse
und die entwicklung der Bioinformatik
Bioinformatik
Was ist Bioinformatik?
Interdisziplinäre Wissenschaft, die Methoden und Software Tools entwickelt, um biologische Daten (besser) analysieren und verstehen zu können
- Bioinformatik verbindet Computerwissenschaften, Statistik, Mathematik, und Ingenieurwissenschaften
- In silico Analysen
Bioinformatik
Ist Biologie ohne Bioinfomatik noch modern?
nein
Bioinformatik
Was macht Translationale Bioinfromatik aus
- storage
- analysis
- Interpretation
(bench to bedside)
Bioinformatik
Technical errors bei sequenzierung und visualisation
Chemistry is never 100%
-Incorporation might not work: phasing
-Incorporation is not blocked: pre-
phasing
- Blocking might not work: pre-phasing
- De-blocking might not work: phasing
Bioinformatik
was ist ein Einzel Nukleoid-Polymorphismus (SNP)
Variation eines einzelnen Basenpaares in einem komplementären DNA-Doppelstrangbezeichnet.
Bioinformatik
Krebsgenetik ist
1. die Untersuchung des Prozesses, beidem multiple Mutationen auftreten, die Veränderungen in
Zelleninduzieren, die zu Krebs führen.
2. das Verständnis der genetischen Prozesse, die dem eigentlichen Krankheitsgeschehen zugrunde liegen.
3. Diese Informationen spielt eine bedeutende Rolle bei Früherkennung, Therapie, Prävention und
Prognose.
- Die individuelle genetische Konstitution
o Vererblicher Krebs
o Sporadischer Krebs
Bioinformatik
FASTQ
FASTQ ist ein text-basiertes Format, in dem sowohl
biologische Sequenzen (normalerweise
Nukleotidsequenzen) und deren korrespondierende
Qualitätswerte (Quality Scores) gespeichert werden
Bioinformatik
Was ist Strukturbiologie
Beschreibung der 3-dimensionalen Struktur eines Proteins basierend auf der Sequenzinformation
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