Bioinformatik an der Universität Bielefeld

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Was ist eine FASTA Datei?

Ein textbasiertes Format zur Darstellung und Speicherung der Primärstruktur von Nukleinsäuren

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Vorteile und Nachteile von PostgreSQL?

Vorteile

Erweiterbarkeit
objektorientiert

Nachteile

teilweise schlechte Performance
nicht so weit verbreitet

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Was versteht man unter Konzenptuellem Design?

Ein konkretes Datenmodell wird gewählt.

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Wofür braucht man SQL?

Es ist eine Anfragensprache für rationale Datenbanken

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Was sind Datenbanken?

Sammlung logisch zusammenhängender Tatsachen (Objekte, Attribute etc.)

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Wie sind Datenbanken aufgebaut?

In drei Ebenen: physikalische, logische und benutzerdefinierte Ebene

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Vorteile und Nachteile von MySQL?

Vorteile

Einfache Bedienbarkeit
schnell

Nachteile

Limitierung in der Funktionalität
Entwicklung stagniert

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Was ist eine XML Datei?

Eine Extensible Markup Language zur Darstellung, Speicherung und Austausch hierarchisch organisiertee Textinformation.

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Warum sind Datenbanken sinnvoller als Ordner?

Weniger Inkonsistenzen und Redundanzen
Gleichzeitiger Zugriff auf Daten möglich
Mehrere Anwendungen können auf die DB zugreifen

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In welcher Beziehung stehen Entitäten und Attribute?

Entitäten werden Attribute zugeordnet.

Entitäten werden untereinander mit Relationen oder Beziehungen verbunden

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Wie gliedert sich der Datenbankentwurf?

Initiales Design
Konzenptuelles Design
Logische Design
Physikalisches Design

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Was ist ein Assembler?

Ein Computerprogramm das virtuelle Nukleotidsequenzen durch sequenzalignment zu längeren Fragmenten zusammenführt

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