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Karteikarten und Zusammenfassungen für R an der TU München

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Methods for dimensionality reduction

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Methods for Clustering

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Multi-dimensional scaling more technically...

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Gaussian mixture model in general

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Deterministic model

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Gaussian noise definition

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PCA and low redundancy

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Intuition of PCA

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The Goals of a simple linear model analysis are?

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R

Methods for dimensionality reduction
Principal component analysis (PCA) Multidimensinal scaling (MDS)

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Methods for Clustering
k-means model based clustering hierarchical clustering comparing clustering results

R

Multi-dimensional scaling more technically...
More technically, MDS refers to a set of related ordination techniques used in information visualization, in particular to display the information contained in a distance matrix. It is a form of non-linear dimensionality reduction. Given a distance matrix with the distances between each pair of objects in a set, and a chosen number of dimensions, N, an MDS algorithm places each object into N-dimensional space such that the between-object distances are preserved as well as possible. If N is one or two, then 2D scatter plots of the resulting points are possible. [Wikipedia]

R

Gaussian mixture model in general
Gaussian mixture model = probabilistic model assumes all the data points are generated from a mixture of a finite number of Gaussian distributions with unknown parameters. One can think of mixture models as generalizing k-means clustering to incorporate information about the covariance structure of the data as well as the centers of the latent Gaussians. [https://scikit-learn.org/stable/modules/mixture.html]

R

Deterministic model
In mathematics, computer science and physics, a deterministic system is a system in which no randomness is involved in the development of future states of the system. A deterministic model will thus always produce the same output from a given starting condition or initial state.

R

Stochastic model
A stochastic model is a tool for estimating probability distributions of potential outcomes by allowing for random variation in one or more inputs over time. The random variation is usually based on fluctuations observed in historical data for a selected period using standard time-series techniques.

R

Gaussian noise definition
Gaussian noise is statistical noise having a probability density function (PDF) equal to that of the normal distribution, which is also known as the Gaussian distribution.[1][2] In other words, the values that the noise can take on are Gaussian-distributed. [Wikipedia]

R

PCA and low redundancy
Correlation indicates that there is redundancy in the data. Due to this redundancy, PCA can be used to reduce the original variables into a smaller number of new variables ( = principal components) explaining most of the variance in the original variables.

R

Intuition of PCA
PCA can be thought of as fitting an n-dimensional ellipsoid to the data.

R

Properties of PCA
The first PC has the largest possible variance PCA is sensitive to the relative scaling of the original variables visualizing high-dimensional data by plotting first two principle components

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Heatmaps
Display the raw data (more than 2 dimensions) and the clustering

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The Goals of a simple linear model analysis are?
1. Prediction of future observations 2. Assessment of the effect of, or relationship between, explanatory variables on the response 3. A general description of data structure

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