Microbe-host interaction an der TU München

Karteikarten und Zusammenfassungen für Microbe-host interaction an der TU München

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Beispielhafte Karteikarten für Microbe-host interaction an der TU München auf StudySmarter:

Which layer of the mucus structure is not colonized by bacteria in the colon under healthy conditions: 

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What is the function of M cells:

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What is Phylogenetic distance?

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Define „phylotype“.

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Define „enterotype“ and how this is related to the diet.

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What is the approximate surface area of the small intestine and the colon?

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What type of differentiated cell type do absorptive progenitor cells produce?

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Which cells of the intestinal epithelium are present in the small intestine, but absent in the large intestine?

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Which cells in the intestinal epithelium produce antimicrobial peptides?

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The intestinal mucus layer is thickest in the:

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Define “metagenomics”.

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Which of the following receptor categories represents a plasma membrane sensor?

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Beispielhafte Karteikarten für Microbe-host interaction an der TU München auf StudySmarter:

Microbe-host interaction

Which layer of the mucus structure is not colonized by bacteria in the colon under healthy conditions: 

Inner stratified mucus (S)

Microbe-host interaction

What is the function of M cells:

Luminal antigen uptake and presentation in PPs

Microbe-host interaction

What is Phylogenetic distance?

The horizontal dimension of this tree gives the amount of genetic change.

Microbe-host interaction

Define „phylotype“.

In microbiology, a phylotype is an environmental DNA sequence or group of sequences sharing more than an arbitrarily chosen level of similarity of a particular gene marker. The most widely used phylogenetic marker is the small subunit ribosomal RNA gene. Two prokaryotic sequences are generally considered as belonging to the same phylotype when they are more than 97–98% identical (for eukaryotes, the values generally used are in the 98–99% nucleotide identity range). In prokaryotic microbiology, phylotypes, often referred to as Operational Taxonomic Units (OTUs), are a proxy for  species.

Microbe-host interaction

Define „enterotype“ and how this is related to the diet.

An enterotype is a classification of living organisms based on its bacteriological ecosystem in the gut microbiome. The discovery of three human enterotypes was announced in the April 2011 issue of Nature by Peer Bork and his associates.[1] They found that enterotypes are not dictated by age, gender, body weight, or national divisions.[2] There are indications that long-term diet influences enterotype.[3] Type 1 is characterized by high levels of Bacteroides, type 2 has few Bacteroides but Prevotella are common, and type 3 has high levels of Ruminococcus.[1][4][5]

The value of classifying by enterotype has been challenged.[6][7]

In a study of gut bacteria of children in Burkina Faso (in Africa), Prevotella made up 53% of the gut bacteria, but were absent in age-matched European children.[8] 

Studies also indicate that long-term diet is strongly associated with the gut microbiome composition—those who eat plenty of protein and animal fats typical of Western diet have predominantly Bacteroides bacteria, while for those who consume more carbohydrates, especially fibre, the Prevotella species dominate.[9] 

Microbe-host interaction

What is the approximate surface area of the small intestine and the colon?

Small intestine 30 m2, colon 2m2

Microbe-host interaction

What type of differentiated cell type do absorptive progenitor cells produce?

Enterocytes

Microbe-host interaction

Which cells of the intestinal epithelium are present in the small intestine, but absent in the large intestine?

Paneth cells

Microbe-host interaction

Which cells in the intestinal epithelium produce antimicrobial peptides?

Paneth cells

Microbe-host interaction

The intestinal mucus layer is thickest in the:

Colon

Microbe-host interaction

Define “metagenomics”.

Metagenomics is the study of genetic material recovered directly from environmental samples. The broad field may also be referred to as environmental genomics, ecogenomics or community genomics.

While traditional microbiology and microbial genome sequencing and genomics rely upon cultivated clonal cultures, early environmental gene sequencing cloned specific genes (often the 16S rRNA gene) to produce a profile of diversity in a natural sample. Such work revealed that the vast majority of microbial biodiversity had been missed by cultivation-based methods.[2]

Because of its ability to reveal the previously hidden diversity of microscopic life, metagenomics offers a powerful lens for viewing the microbial world that has the potential to revolutionize understanding of the entire living world.[3] As the price of DNA sequencing continues to fall, metagenomics now allows microbial ecology to be investigated at a much greater scale and detail than before. Recent studies use either „shotgun“ or PCR directed sequencing to get largely unbiased samples of all genes from all the members of the sampled communities.

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Which of the following receptor categories represents a plasma membrane sensor?

CLR

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