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Lernmaterialien für BioOC Übung an der TU Dortmund

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TESTE DEIN WISSEN

Wie binden Interkalatoren an die DNA?

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TESTE DEIN WISSEN

Von Interkalation in die Desoxyribonukleinsäure (DNA) spricht man, wenn sich bestimmte Moleküle, die vollständig oder teilweise planar sind, in die Doppelhelix der DNA zwischen benachbarte Basenpaare einschieben. Durch diese Einlagerung wird die Replikation und Transkription der DNA gestört.

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TESTE DEIN WISSEN

Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?

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TESTE DEIN WISSEN

-Hydrazin

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TESTE DEIN WISSEN

In welchen Strukturen kann RNA vorliegen?

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TESTE DEIN WISSEN

-Doppelhelix

-Haarnadel

-Ausbuchtung

-Einzelstrang

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TESTE DEIN WISSEN

Which linkers are used in solid phase peptide synthesis that give you a peptide with a c-terminal amide as the final product. Also mention for which synthetic strategy they are used (Boc or Fmoc strategy)

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TESTE DEIN WISSEN

MBHA for Box SPPS and Rink Amide for Fmoc SPPS

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TESTE DEIN WISSEN

Überleben die Antikörper ewig?

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TESTE DEIN WISSEN

Antikörper haben eine Halbwertszeit von ca. 8 Tagen. Antikörper-produzierende B-Zellen und Gedächtniszellen leben deutlich länger und werden nach einer Infektion schnell aktiviert

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TESTE DEIN WISSEN

Wie können die Tertiärstrukturen im Labor hergestellt werden?

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TESTE DEIN WISSEN

Sie können programmiert werden durch die Basensequenz.
Synthese eines Oligonucleotids entsprechender Länge und Sequenz.

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TESTE DEIN WISSEN

Welche Interaktionen stabilisieren die DNA-Doppelhelix?

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TESTE DEIN WISSEN

-Wasserstoffbrücken

-Pi-Stacking

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TESTE DEIN WISSEN

Welche Eigenschaften weisen Interkalatoren auf?

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TESTE DEIN WISSEN

Flache, aromatische Strukturen lagern sich zwischen Nucleobasen -> sogenanntes pi-stacking

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TESTE DEIN WISSEN

Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?

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TESTE DEIN WISSEN

-Hydrazin

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TESTE DEIN WISSEN

Which of the amino acids( Ser, His, Tyr, Cys, Arg, Glu, Lys) have side-chains which are mainly protonated at
physiological pH? Which are mainly deprotonated?

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TESTE DEIN WISSEN

•Physiological pH = 7.4

•Protonated: Arg, Lys

pH < pKa

•Deprotonated: Asp, Glu

pH > pKa

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TESTE DEIN WISSEN

Why is it advantageous to add HOBt to the activation of amino acids when using a carbodiimide?

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TESTE DEIN WISSEN

HOBt reduces racemization and potential isourea side product formation effectively increasing the yield.

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TESTE DEIN WISSEN

What conditions are required for the cleavage of peptides from the solid phase when using the Wang or Rink Amide resins. What happens to the side chain protecting groups under these conditions?

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TESTE DEIN WISSEN

Concentrated TFA is required. Protecting groups are removed as well if they are acid sensitive. Therefore scavengers are required (typically TIPS and H2O)

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  • 121568 Karteikarten
  • 3465 Studierende
  • 130 Lernmaterialien

Beispielhafte Karteikarten für deinen BioOC Übung Kurs an der TU Dortmund - von Kommilitonen auf StudySmarter erstellt!

Q:

Wie binden Interkalatoren an die DNA?

A:

Von Interkalation in die Desoxyribonukleinsäure (DNA) spricht man, wenn sich bestimmte Moleküle, die vollständig oder teilweise planar sind, in die Doppelhelix der DNA zwischen benachbarte Basenpaare einschieben. Durch diese Einlagerung wird die Replikation und Transkription der DNA gestört.

Q:

Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?

A:

-Hydrazin

Q:

In welchen Strukturen kann RNA vorliegen?

A:

-Doppelhelix

-Haarnadel

-Ausbuchtung

-Einzelstrang

Q:

Which linkers are used in solid phase peptide synthesis that give you a peptide with a c-terminal amide as the final product. Also mention for which synthetic strategy they are used (Boc or Fmoc strategy)

A:

MBHA for Box SPPS and Rink Amide for Fmoc SPPS

Q:

Überleben die Antikörper ewig?

A:

Antikörper haben eine Halbwertszeit von ca. 8 Tagen. Antikörper-produzierende B-Zellen und Gedächtniszellen leben deutlich länger und werden nach einer Infektion schnell aktiviert

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Q:

Wie können die Tertiärstrukturen im Labor hergestellt werden?

A:

Sie können programmiert werden durch die Basensequenz.
Synthese eines Oligonucleotids entsprechender Länge und Sequenz.

Q:

Welche Interaktionen stabilisieren die DNA-Doppelhelix?

A:

-Wasserstoffbrücken

-Pi-Stacking

Q:

Welche Eigenschaften weisen Interkalatoren auf?

A:

Flache, aromatische Strukturen lagern sich zwischen Nucleobasen -> sogenanntes pi-stacking

Q:

Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?

A:

-Hydrazin

Q:

Which of the amino acids( Ser, His, Tyr, Cys, Arg, Glu, Lys) have side-chains which are mainly protonated at
physiological pH? Which are mainly deprotonated?

A:

•Physiological pH = 7.4

•Protonated: Arg, Lys

pH < pKa

•Deprotonated: Asp, Glu

pH > pKa

Q:

Why is it advantageous to add HOBt to the activation of amino acids when using a carbodiimide?

A:

HOBt reduces racemization and potential isourea side product formation effectively increasing the yield.

Q:

What conditions are required for the cleavage of peptides from the solid phase when using the Wang or Rink Amide resins. What happens to the side chain protecting groups under these conditions?

A:

Concentrated TFA is required. Protecting groups are removed as well if they are acid sensitive. Therefore scavengers are required (typically TIPS and H2O)

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