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Lernmaterialien
Wie binden Interkalatoren an die DNA?
Von Interkalation in die Desoxyribonukleinsäure (DNA) spricht man, wenn sich bestimmte Moleküle, die vollständig oder teilweise planar sind, in die Doppelhelix der DNA zwischen benachbarte Basenpaare einschieben. Durch diese Einlagerung wird die Replikation und Transkription der DNA gestört.
Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?
-Hydrazin
In welchen Strukturen kann RNA vorliegen?
-Doppelhelix
-Haarnadel
-Ausbuchtung
-Einzelstrang
Which linkers are used in solid phase peptide synthesis that give you a peptide with a c-terminal amide as the final product. Also mention for which synthetic strategy they are used (Boc or Fmoc strategy)
MBHA for Box SPPS and Rink Amide for Fmoc SPPS
Überleben die Antikörper ewig?
Antikörper haben eine Halbwertszeit von ca. 8 Tagen. Antikörper-produzierende B-Zellen und Gedächtniszellen leben deutlich länger und werden nach einer Infektion schnell aktiviert
Wie können die Tertiärstrukturen im Labor hergestellt werden?
Sie können programmiert werden durch die Basensequenz.
Synthese eines Oligonucleotids entsprechender Länge und Sequenz.
Welche Interaktionen stabilisieren die DNA-Doppelhelix?
-Wasserstoffbrücken
-Pi-Stacking
Welche Eigenschaften weisen Interkalatoren auf?
Flache, aromatische Strukturen lagern sich zwischen Nucleobasen -> sogenanntes pi-stacking
Welche Chemikalien reagieren mit der 6-Position von T?
-Hydrazin
Which of the amino acids( Ser, His, Tyr, Cys, Arg, Glu, Lys) have side-chains which are mainly protonated at
physiological pH? Which are mainly deprotonated?
•Physiological pH = 7.4
•Protonated: Arg, Lys
pH < pKa
•Deprotonated: Asp, Glu
pH > pKa
Why is it advantageous to add HOBt to the activation of amino acids when using a carbodiimide?
HOBt reduces racemization and potential isourea side product formation effectively increasing the yield.
What conditions are required for the cleavage of peptides from the solid phase when using the Wang or Rink Amide resins. What happens to the side chain protecting groups under these conditions?
Concentrated TFA is required. Protecting groups are removed as well if they are acid sensitive. Therefore scavengers are required (typically TIPS and H2O)
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