Zellbiologie Biochemie an der RWTH Aachen

Karteikarten und Zusammenfassungen für Zellbiologie Biochemie im Medizin Studiengang an der RWTH Aachen in Aachen

CitySTADT: Aachen

CountryLAND: Deutschland

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Weshalb sind Aminosäuren bei neutralem pH-wert Zwitterionen?

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Was ist der Unterschied zwischen Anpassungen von Proteinen bzw Enzymen?

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Was bezeichnet man als „random coil“?

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In wiefern hängt bei geladenen AS-Seitenketten der pKa-Wert mit der Ladung zusammen?

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Was sind Enzyme?

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Was ist Calmodulin?

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Wie werden Aminosäuren zu Polypeptidketten verknüpft?

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Wie können Polypeptide posttranslational modifiziert werden? 

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Was ist die Quartiärstruktur von Proteinen?

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Welche Enzymhauptklassen gibt es?

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Was versteht man unter dem hydrophoben Effekt?

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Welche Klassen von Biomolekülen sind maßgeblich?

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Zellbiologie Biochemie

Weshalb sind Aminosäuren bei neutralem pH-wert Zwitterionen?

AS sind Ampholyte
Aminogruppe Protonenakzeptor (pKa ca 9-10) NH3^+ —> NH2

Carboxylgruppe Protonendonor (pKa ca 2) COOH —> CoO^-
Bei neutralem pH also Zwitterionen 

Zellbiologie Biochemie

Was ist der Unterschied zwischen Anpassungen von Proteinen bzw Enzymen?

Proteine: Anpassung an zelluläre Bedürfnisse —> Signale integrieren, physiologische Anpassung
Enzyme: metabolische Anpassung

Zellbiologie Biochemie

Was bezeichnet man als „random coil“?
  • Sekundärstruktur ohne erkennbare Struktur 
  • Aber genauso wichtig für die Proteinstruktur 
  • Stabilisiert durch Ionenbindungen, VanderWaals-Bindungen
  • Oft mit Prolin (ringförmig), teilweise als Strukturbrecher 

Zellbiologie Biochemie

In wiefern hängt bei geladenen AS-Seitenketten der pKa-Wert mit der Ladung zusammen?

PKa << 7 negativ geladen (Asparagin, Glutamine)
PKa≈7 positiv oder negativ sein (Histidin)
PKa >> 7 positiv geladen (bei neutralem pH proponierte) (Lysin, Arginine)

Zellbiologie Biochemie

Was sind Enzyme?

Katalysatoren —> beschleunigen chemische Reaktionen
Aktives Zentrum
In Bindungstaschen optimale Positionierung der Substrate zu einander
Substratbindung —> Konformationsänderung 

Zellbiologie Biochemie

Was ist Calmodulin?

calmodulin als intrazellulärer Ca2+ Sensor und Signalüberträger
CaM hat 4 Ca2+ Bindungsstellen: steigt intrazelllär Ca2+Konzentration—>Konformationsänderung —> CaM-Kinase kann binden und aktiviert werden 

Zellbiologie Biochemie

Wie werden Aminosäuren zu Polypeptidketten verknüpft?

– Proteinbiosynthese am Ribosom ausschließlich die 20 proteinogenen L-alpha-AS
– Kondensation (Wasserabspaltung) zwischen Aminogruppe und Carboxylgruppe
– Synthese immer von N-Terminus nach C-Terminus
– Sequenz linear

0-10 Aminosäuren: (Oligo) Peptide
10-50 AS: (Poly) Peptide
>50 AS: Proteine

Zellbiologie Biochemie

Wie können Polypeptide posttranslational modifiziert werden? 

– an N und C Terminus —> Formylierung, Acetylierung
Modifizierung der Seitenketten: kleine funktionelle Gruppen (Phosporylierung..), Lipide, Glykosylierung, kleine Proteine
Disulfidbrücken
Peptidasen: Ausschneiden von Stücken

Zellbiologie Biochemie

Was ist die Quartiärstruktur von Proteinen?

Manche Proteine Monomere: Myoglobin
Andere große Komplexe
Heterogen wie Hämoglobin
Quartiärstruktur genauso stabilisiert wie Tertiärstruktur

Zellbiologie Biochemie

Welche Enzymhauptklassen gibt es?

1. Oxidoreduktasen: Redox-Reaktionen -> Katalase

2. Transferasen: Übertragen von funktionellen Gruppen -> Kinasen

3. Hydrolasen: Hydrolytische Spaltung -> Phosphatasen

4. Lyasen: Nichthydrolytische Eliminierung -> Adenylatcyclase

5. Isomerasen: Isomerierung -> Prolin-cis-trans-Isomerase

6. Ligasen: ATP-verbrauchende Bindungsknüpfung -> DNA-Ligase

Zellbiologie Biochemie

Was versteht man unter dem hydrophoben Effekt?

Peptidketten lagern sich so zusammen, dass unpolare, hydrophobe Ketten sich im als Kern befinden
Polare hydrophil Seitenketten stehen dann außen in Kontakt mit Wasser

Zellbiologie Biochemie

Welche Klassen von Biomolekülen sind maßgeblich?

Proteine: strukturelle und funktionelle Aufagben
Lipide: Membranbestandteile und Energiespeicher
Kohlenhydrate: Energiespeicher/ -Träger, strukturelle Aufgaben
Nukleinsäuren. Informationsträger

Gradient

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