Molekularbiologie für Biotechnologen an der RWTH Aachen

Karteikarten und Zusammenfassungen für Molekularbiologie für Biotechnologen an der RWTH Aachen

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What effects RNA stability?

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How is GlcNAc added or removed?

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What does Sumo stand for?

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Where are hedgehog and inteins found?

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Is the half-life of all RNAs similar?

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Which kind of processing steps can eukaryotic RNA encounter?

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What is an anti-sigma factor?

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What are the major two differences between RNA and DNA?

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What are potential reasons for transcriptional pausing?

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Name the three major phases in transcription

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Give the names of the two major model for eucaryotic RNA polymerase II termination?

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Which kind of amino acids would you expect to find in proteins that contact DNA and why?

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Molekularbiologie für Biotechnologen

What effects RNA stability?

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Molekularbiologie für Biotechnologen

How is GlcNAc added or removed?

Addition to serin or threonine by 

O-GlcNAc transferase 

and removal is by 

O- acetylglucosaminidase


(reversible)

Molekularbiologie für Biotechnologen

What does Sumo stand for?

Small ubiquitin-like modifiers

Molekularbiologie für Biotechnologen

Where are hedgehog and inteins found?

Inteins are found in single-celled organisms and Hedgehog only in metazoans, but their self-splicing domains are similar (shown), suggesting evolutionary conservation


Molekularbiologie für Biotechnologen

Is the half-life of all RNAs similar?

open

Molekularbiologie für Biotechnologen

Which kind of processing steps can eukaryotic RNA encounter?

Splicing

5' Capping

Polyadenylation

Molekularbiologie für Biotechnologen

What is an anti-sigma factor?

In the regulation of gene expression in prokaryotes, anti-sigma factors bind to sigma factors and inhibit transcriptional activity.


Molekularbiologie für Biotechnologen

What are the major two differences between RNA and DNA?

  • Uracil instead of Thymin
  • Ribose instead of deoxyribose.


Molekularbiologie für Biotechnologen

What are potential reasons for transcriptional pausing?

DNA Damage or unusual changes/obstructions to the DNA structure which leads to an elongation pause.


Generally Transcriptional arrest occurs when the enzyme cannot resume RNA synthesis 

Molekularbiologie für Biotechnologen

Name the three major phases in transcription

Initiation, elongation, termination

Molekularbiologie für Biotechnologen

Give the names of the two major model for eucaryotic RNA polymerase II termination?

Allosteric model

Torpedo model

Molekularbiologie für Biotechnologen

Which kind of amino acids would you expect to find in proteins that contact DNA and why?

Zinc-Fingers = Cys2His2

Leucine zipper = Lysin, Arginin (basische AS, hydrophob)


His, lys, Arg = positiv geladen

Cys = wohl wichtig für zinc

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