Structural Biology an der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg

Karteikarten und Zusammenfassungen für Structural Biology an der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg

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Covalent interactions

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Loops

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Different types of beta sheets

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CATH =

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Tertiary structure

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Quartenary structure

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Location of ATP Synthase

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Binding-change mechanism

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Proton translocation of c-ring (3 steps)

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Symmetry =

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Symmetry operations

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Structural Biology

Covalent interactions

Disulfide bridges

Structural Biology

Loops

- Long

- Mostly no regular backbone interactions

Structural Biology

Different types of beta sheets

Parallel and Antiparallel beta sheets

Structural Biology

CATH =

- Classification: secondary structures

- Architecture: general arrangement of secondary structure

- Topology: fold level (connectivity)

- Homologuous superfamily

Structural Biology

Tertiary structure

- 3D structure of folded proteins

- Arrangement of secondary structures within a single protein chain

Structural Biology

Quartenary structure

- Assembly of 2 or more protein chains into a protien complex

- Homo/Hetero multimers possible to allow specific functions

Structural Biology

Location of ATP Synthase

In inner membrane of mitochondria

Structural Biology

Binding-change mechanism

- Loose: ADP & Pi are loosely bound at catalytic site

- Tight: Tight binding of substrates to allow ATP synthesis

- Open: Catalytic site opens & ATP is released

Structural Biology

Proton translocation of c-ring (3 steps)

1. proton enter subunit A through half-channel & protonate Glu

2. Interaction between Glu&Asn

3. Protonated Glu reaches 2nd half channel & releases protons

Structural Biology

Symmetry =

symmetrical operation leads to identical state to orginal state

Structural Biology

Symmetry operations

- Point of inversion

- Mirror plane

- Glide plane

Structural Biology

Space groups

Combination of Bravais lattice & symmetry

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