Immunology: Antibodies And Their Use In Research an der Hochschule Bonn-Rhein-Sieg

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What can pepsin do to an antibody's structure?

- It can break the disulphide bonds which connect the heavy and light chain

- this yields the antigen binding fragment (Fab region) and the crystallizable/constant fragment (Fc region)

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What is the Fab region and what is it capable of?

= antigen binding fragment

capable of:
- binding the antigen without Fc region
- neutralization

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What is an epitope? What binds the epitope?

specific part on antigen, where top part of variable region (paratope) of antibody binds

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Is it possible, that an antibody can have different paratopes, which bind to the same antigen, but at different epitopes?

Yes

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What is included in the hypervariable region of an antibody? Why is this region called like that?

- The top parts of the light and heavy chain
- parts of the paratope region
- it is called like that, because it is involved in somatic hypermutation

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What are CDRs and what is their function? Where are they found?

= complementarity determing regions

- regions of antibody that determine the compatibility of antibody to antigen
- found on both heavy and light chain

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Which forces are involved in antigen-antibody interaction and complementarity?

Non-covalent forces like...

- electrostatic forces
- Van der Waals forces
- hydrophobic forces
- hydrogen bonds

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What does affinity mean?

Single binding strength of one paratope to its epitope

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What does avidity mean?

Total binding strength of an antibody

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Mostly, the total binding strength is made up of ____ binding sites, with IgA and IgM being an exeption.

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Of how many binding sites can the total binding strength of IgM and IgA be made up?

IgM: up to 10

IgA: up to 4

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Which antibody isotype is very rare and not usually secreted?

IgM

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