TMC at Université Des Sciences Humaines (Strasbourg II) | Flashcards & Summaries

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Lernmaterialien für TMC an der Université des Sciences Humaines (Strasbourg II)

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TESTE DEIN WISSEN
Southern Blot
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TESTE DEIN WISSEN
ADN
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TESTE DEIN WISSEN
Les ARN ribosomaux (ARNr)
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TESTE DEIN WISSEN
Sont traduits en protéines ribosomales.
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TESTE DEIN WISSEN
Western Blot
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TESTE DEIN WISSEN
Protéines
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TESTE DEIN WISSEN
La molécule d‘ARNm d‘une cellule eucaryote
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TESTE DEIN WISSEN
Peut être traduite simultanément par plusieurs ribosomes.
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TESTE DEIN WISSEN
Nothern blot

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TESTE DEIN WISSEN
ARN
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TESTE DEIN WISSEN
Les mutations de perte de fonction sont généralement récessives.
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TESTE DEIN WISSEN
Vrai
Les mutations qui éliminent la fonction d‘une protéine sont généralement récessives. Dans un organisme diploide, une copie de l‘allèle de type sauvage peut généralement compenser l‘allèle de perte de fonction. Il est important de noter, cependant, que dans certains cas, la moitié de la quantité normale de produit génique n‘est par suffisante pour produire le phénotype normal. Cette situation, appelée haploinsuffisance, conduit à un phénotype mutant pour une mutation de perte de fonction. C‘est le cas de certaines protéines ribosomales.
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TESTE DEIN WISSEN
Une séquence nucleotidique est traduite quand elle est sous forme:
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TESTE DEIN WISSEN
ARNm
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TESTE DEIN WISSEN
?!La molécule d‘ARN
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TESTE DEIN WISSEN
Est un polymère de nucléotides liés par des liaisons phosphodiester.
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TESTE DEIN WISSEN

Organisez de façon chronologique les paramètres à prendre en considération dans une expérience de CLIP-seq: 

-La technique de pontage 

-La digestion par une RNAse 

-La technique de séquençage des ADNc 

-L'anticorps pour l'immunprécipitation 


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TESTE DEIN WISSEN

1  La technique de pontage pour stabiliser les interactions ARN/protéine
2  L'anticorps pour l'IP (est-ce que cette protéine me permet de
répondre à la question posée, la spécificité de l'anticorps...)
3  La digestion par une RNAse (temps de digestion, quelle RNAse choisir?...)
4  La technique de séquençage des ADNc

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TESTE DEIN WISSEN
Si chaque cycle de PCR double la quantité d‘ADN synthétisé dans le cycle précédent, 10 cycles donneront une amplification d‘environ 10^3, 20 cycle donneront une amplification d‘environ 10^6, et 30 cycles donneront une amplification d‘environ 10^9.
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TESTE DEIN WISSEN
Vrai
Si chaque cycle double laquantité d‘ADN, alors 
10 cycles = 2^10 fois (=  1024),
20 cycles = 2^20 (= 1,05x10^6) et 
30 cycles = 2^30 (= 1,07x10^9)

=> Il est utile de se rappeler que 2^10 est à peu près = 10^3 = 1000. Cette relation simple vous permet d‘estimer rapidement la réponse à ce problÈme sans avoir recours à votre calculatrice. Elle est pratique dans une variété de contextes.)

-> 10 cycles  2^10  =  10^3
    20 cycles 2^20 =  2^10 x 2^10 =  10^3 x 10^3 = 10^6
    30 cycles 2^30  =…
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TESTE DEIN WISSEN
Dans un organisme dont le génome a été séquencé, l‘identification du gène mutant responsable d‘un phénotype intéressant est aussi facile pour les mutations induites par mutgenèse chimique (substitution nucléotidiques) que pour celles générées par mutagenèse insertionnelle (insertion d‘une séquence dans le gène cible).
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TESTE DEIN WISSEN
Faux
Même avec un génome séquencé, l‘identification d‘un gène qui a été muté par mutagenèse chimique reste un processus laborieux. Une telle mutation doit être localisée à un emplacement chromosomique (un processus qui prend du temps) et ensuite les gènes candidats dans cette région (dont beaucoup sont connus grâce aux efforts de séquencage du génome) peuvent être criblés pour la présence de la mutation. La mutagenèse insertionnelle, en revanche, place une séquence connue - souvent un élément transposable ou un gène rapport (LacZ, GFP…) - dans le gène muté. Il s‘agit d‘un processus simple pour obtenir des informations de séquence adjacentes à un segment de séquence connue. Dans un génome séquencé, un peu de séquence est tout cequi est nécessaire pour identifier l‘emplacement de l‘ADN inséré et du gène muté.
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TESTE DEIN WISSEN
Dans les cellules eucaryotes
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TESTE DEIN WISSEN
ARNr 18S forment la sous - unité ribosomale 40S
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Q:
Southern Blot
A:
ADN
Q:
Les ARN ribosomaux (ARNr)
A:
Sont traduits en protéines ribosomales.
Q:
Western Blot
A:
Protéines
Q:
La molécule d‘ARNm d‘une cellule eucaryote
A:
Peut être traduite simultanément par plusieurs ribosomes.
Q:
Nothern blot

A:
ARN
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Q:
Les mutations de perte de fonction sont généralement récessives.
A:
Vrai
Les mutations qui éliminent la fonction d‘une protéine sont généralement récessives. Dans un organisme diploide, une copie de l‘allèle de type sauvage peut généralement compenser l‘allèle de perte de fonction. Il est important de noter, cependant, que dans certains cas, la moitié de la quantité normale de produit génique n‘est par suffisante pour produire le phénotype normal. Cette situation, appelée haploinsuffisance, conduit à un phénotype mutant pour une mutation de perte de fonction. C‘est le cas de certaines protéines ribosomales.
Q:
Une séquence nucleotidique est traduite quand elle est sous forme:
A:
ARNm
Q:
?!La molécule d‘ARN
A:
Est un polymère de nucléotides liés par des liaisons phosphodiester.
Q:

Organisez de façon chronologique les paramètres à prendre en considération dans une expérience de CLIP-seq: 

-La technique de pontage 

-La digestion par une RNAse 

-La technique de séquençage des ADNc 

-L'anticorps pour l'immunprécipitation 


A:

1  La technique de pontage pour stabiliser les interactions ARN/protéine
2  L'anticorps pour l'IP (est-ce que cette protéine me permet de
répondre à la question posée, la spécificité de l'anticorps...)
3  La digestion par une RNAse (temps de digestion, quelle RNAse choisir?...)
4  La technique de séquençage des ADNc

Q:
Si chaque cycle de PCR double la quantité d‘ADN synthétisé dans le cycle précédent, 10 cycles donneront une amplification d‘environ 10^3, 20 cycle donneront une amplification d‘environ 10^6, et 30 cycles donneront une amplification d‘environ 10^9.
A:
Vrai
Si chaque cycle double laquantité d‘ADN, alors 
10 cycles = 2^10 fois (=  1024),
20 cycles = 2^20 (= 1,05x10^6) et 
30 cycles = 2^30 (= 1,07x10^9)

=> Il est utile de se rappeler que 2^10 est à peu près = 10^3 = 1000. Cette relation simple vous permet d‘estimer rapidement la réponse à ce problÈme sans avoir recours à votre calculatrice. Elle est pratique dans une variété de contextes.)

-> 10 cycles  2^10  =  10^3
    20 cycles 2^20 =  2^10 x 2^10 =  10^3 x 10^3 = 10^6
    30 cycles 2^30  =…
Q:
Dans un organisme dont le génome a été séquencé, l‘identification du gène mutant responsable d‘un phénotype intéressant est aussi facile pour les mutations induites par mutgenèse chimique (substitution nucléotidiques) que pour celles générées par mutagenèse insertionnelle (insertion d‘une séquence dans le gène cible).
A:
Faux
Même avec un génome séquencé, l‘identification d‘un gène qui a été muté par mutagenèse chimique reste un processus laborieux. Une telle mutation doit être localisée à un emplacement chromosomique (un processus qui prend du temps) et ensuite les gènes candidats dans cette région (dont beaucoup sont connus grâce aux efforts de séquencage du génome) peuvent être criblés pour la présence de la mutation. La mutagenèse insertionnelle, en revanche, place une séquence connue - souvent un élément transposable ou un gène rapport (LacZ, GFP…) - dans le gène muté. Il s‘agit d‘un processus simple pour obtenir des informations de séquence adjacentes à un segment de séquence connue. Dans un génome séquencé, un peu de séquence est tout cequi est nécessaire pour identifier l‘emplacement de l‘ADN inséré et du gène muté.
Q:
Dans les cellules eucaryotes
A:
ARNr 18S forment la sous - unité ribosomale 40S
TMC

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