Nutrigenomics & Molekularbiologie at Universität Hohenheim

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snRNA

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scRNA

- Bedeutung?

- Funktion?

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snoRNPs

- = ?

- steuern? → wie genau funktioniert das?

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"Wobble base pairing"

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tRNA-Beladung

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RNAi

& RISC

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Poly-(A)-Schwanz

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Splicen

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Funktionelle Gen-Varianten

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bSECIS

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Wodurch kommen "slippery sequences" &  "Choke points" zustande?

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Nutrigenomics & Molekularbiologie

snRNA

 = small nuclear RNA

Bestandteil des Spleisosoms

Nutrigenomics & Molekularbiologie

scRNA

- Bedeutung?

- Funktion?

small cytoplasmatic RNA

Bestandteil von Signalerkennungpartikeln

Nutrigenomics & Molekularbiologie

snoRNPs

- = ?

- steuern? → wie genau funktioniert das?

= small nuclear Ribonucleoproteins

steuern die Ribosom-Assemblierung

1. Import der Ribosomalproteine in den Kern

2. Assemblierung im Zellkern

3. Export über Kernporen

4. Korrekte Faltung im Cytoplasma

Nutrigenomics & Molekularbiologie

"Wobble base pairing"

"Wackelnden/Schwabbelnden Basenpaarungseffekt"

- nur 41 tRNAs aber theoretisch 61 mögliche Basentripplets

- tRNA weisen durch eine Veränderung an der  1. Stelle des Anticodons eine höhere Flexibilität auf

→ häufig kein Standard NT sondern ein prozessiertes NT (= chemisch modifiziertes Nucleotid, z. B:  Inosin)

→ Ermöglicht das binden von an drei verschiedene Kodons, die alle in die gleiche AS übersetzt werden → degenerierter Code

Nutrigenomics & Molekularbiologie

tRNA-Beladung

via. Aminoacetyl-tRNA-Synthese

  1. Aktivierung der AS durch phosphorylierung (via ATP) → Aminoacetyl-AMP + PPi
  2. Übertragung der AS: Aminoacetyl-AMP + tRNA → Aminoacetyl-tRNA + AMP

Nutrigenomics & Molekularbiologie

RNAi

& RISC

= RNA-Interferenz (2 Typen: miRNA & siRNA)

mRNA wird durch Bindung von RNAi gehemmt → keine Translation möglich

auch als molekulares Tool zum gene knockdown (reversibel) verwendet

= RNA-induced silencing complex


→ z. B. "Dicer"

Nutrigenomics & Molekularbiologie

Poly-(A)-Schwanz

Enzymkkomplex

  • mit Endonuclease: entfernt 3' Ende bis AAUAA
  • Polyadenylat Polymerase (=Polynukleotid Adenylyltransferase) fügt   via ATP unter Abspaltung von PPi 200-250 A an (template unabhängig)

Nutrigenomics & Molekularbiologie

Splicen

Group I Introns (Mitos, Chlorop, mRNA) Hauptgruppe

Splicing durch Bildung einer Lariatstruktur (2'5' Phosphodiesterbindung)

Nutrigenomics & Molekularbiologie

Funktionelle Gen-Varianten

gleiches Gen → durch Spleißen entstehen andere Proteine

(z. B. Calcitonin & CGRP; oder IgM (frei & membranverankert)


Nutrigenomics & Molekularbiologie

bSECIS

bacterial Selenocystein Insertion Sequenz

→ ermöglichen das Umgehen von einzelnen Stoppcodons und das einbauen von Selenocystein

Voraussetzung: bSECIS & Stoppcodon in einer best. Sequenz

→ einzelstränige RNA bildet Hairpin → sec-spez. tRNA kann binden

Nutrigenomics & Molekularbiologie

Wodurch kommen "slippery sequences" &  "Choke points" zustande?

durch die "Optimierte Verwendung von tRNAs

→ best. tRNAs nicht so häufig vs. sehr häufig vorhanden → Beschleunigung oder Verlangsamen der Translation

Nutrigenomics & Molekularbiologie

INDELS

  • Lesetratermutationen
  • Insertion = Einfügen eine Nukleotids
  • DELetion = Entfernen eines Nucleotids
  • führen zu
    • Truncation = Verkürzung durch neues StoppCodon
    • Elongation = Verlängern durch überlesen eines StoppCodons

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