Biochemie at Humboldt-Universität zu Berlin

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Wie kann ein Enzym/Protein erkannt werden?

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Was ist ein Enzymassay?

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Beschreibe die Gelektrophorese.

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Wie heißen die Proteine von 

4-10 AS

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Was sagt die Einheit Dalton aus?

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Wofür sind Prolylisomerasen gut?

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Was stellt das Ramachandran-Diagramm dar?

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Was sind normalerweise die Werte für n,d,p der alpha-Helix Struktur? Ist diese im Normalfall links oder rechtsgängig?

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Was ist eine Domänenstruktur? Was ist eine Untereinheitenstruktur?

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Was sind Disulfid-Brücken? Wofür sind sie gut?

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Was ist der größte Unterschied zwischen Hämoglobin und Myglobin?

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Beschreibe die Gelfiltrations-/Größenausschluss-Chromatographie.

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Biochemie

Wie kann ein Enzym/Protein erkannt werden?

1. Enzymassays

2. Gelelktrophorese



Biochemie

Was ist ein Enzymassay?

=Erkennen des Enzyms anhand seiner Aktivität

Ein Produkt ODER Substrat hat charakteristische, nachweißbare Absorption -> Spektroskopie -> finden des Enzyms


Biochemie

Beschreibe die Gelektrophorese.

=> Gemisch wandert durch ein Molekularsieb aus Polyacrylamid -> kleine Moleküle wandern schneller durch als größere

bei SDS-Page: pro 1AS ein SDS Molekül -> Protein wird negativ -> wandert zum pos Pol


+Färbemittel um Protein sichtbar zu machen


relative Beweglichkeit proportional zum Logarithmus ihrer Masse -> logarithmische Trennung -> Abschätzen der Größe

Biochemie

Wie heißen die Proteine von 

4-10 AS

1-100 AS
über 100 AS

Oligopeptid

Polypeptid

Makropeptid

Biochemie

Was sagt die Einheit Dalton aus?

atomare Masseneinheit

1g/mol = 1 Da

mittlere AS 110 Da -> 300 AS (1 Da etwa 3 AS)

Biochemie

Wofür sind Prolylisomerasen gut?

Hohe Aktivierungsenergie für Umwandlung von cis in trans-Polybindung.

-> verringern die notwendige Aktivierungsenergie und beschleunigen die Einstellung des Gleichgewichts

=> für die Umwandlung cis in trans oder umgekehrt

- Faltungshelfer

Biochemie

Was stellt das Ramachandran-Diagramm dar?

-> stellt die statistische Verteilung der Kombinationen der Torsionswinkel dar

-> durch sterische Abstoßungen der Seitenketten nur begrenzte Zahl an Kombis möglich

Biochemie

Was sind normalerweise die Werte für n,d,p der alpha-Helix Struktur? Ist diese im Normalfall links oder rechtsgängig?

n: Reste pro Windung = 3,6

d: Abstand der Windungen = 5,4 A°

p: Scheibung od Translation od pitch = d/n =1,5 A°


Normalfall ist die rechtsgängige Helix -> günstigere Torsionswinkel


alpha-helikale Bereich eines Polypeptids: rechtsdrehend, 3,6 aa/Drehung

Seitenketten von der Helixachse weg

Biochemie

Was ist eine Domänenstruktur? Was ist eine Untereinheitenstruktur?

Domänenstruktur: eine Peptidkette

Untereinheitenstruktur: mehr als eine Peptidkette (zB Hämoglobin) -> Proteinkomplex

Biochemie

Was sind Disulfid-Brücken? Wofür sind sie gut?

= Bindung zwischen S-Atome zweier Cystein-Moleküle in AS

-> wichtig für die Proteinfaltung


Biochemie

Was ist der größte Unterschied zwischen Hämoglobin und Myglobin?

Hämoglobin enthält eine HÄM-Gruppe (Tetrapyrolkofaktor= Ringsystem um Eisen) zur Bindung von O2

--> diese Bindung ist kooperativ ->bei Myglobin nicht

Biochemie

Beschreibe die Gelfiltrations-/Größenausschluss-Chromatographie.

Kohlenhydratpolymerkügelchen + Proteinprobe -> kleine Proteine dringen in die Hohlräume der Kügelchen 

 große Protein können nicht eindringen -> fallen nach unten

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