Biochem 🧪 at Hochschule Bonn-Rhein-Sieg | Flashcards & Summaries

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enzyme activity U
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μmol substrate conversion/ min amount of product formed within a certain time is proportional to the enzyme activity
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alkaline phosphatase (AP)
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homodimeric metalloenzyme (needs Zn2+ and Mg2+) stabilized by zinc ions (function can be abolished by the removal of zinc ions) magnesium does not activate AP but increases its activity (cofactor) catalyzes the hydrolysis of phosphate monoesters to form inorganic phosphate and alcohol must be kept on ice at all times! 140,000 Da
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specific enzyme activity
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U/mg protein
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formula for calculation of protein concentration (Warburg christian method)
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TESTE DEIN WISSEN
c [mg/ml]= (1,55 * E 280 ) –(0,76 * E 260 )
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3 forms of coomassie brilliant blue
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cationic (brown), neutral (green) and anionic (blue) when protein binds, the cationic form is converted to a stable unprotonated blue form
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chelating agents
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...bind metal ions
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glutamic acid

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acidic

not essential for humans
- behaves similarly to aspartic acid, and has a longer, slightly more flexible side chain

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metal binding sites of E. coli AP (M1, M2, M3)
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M1: specific for Zn2+ (2 histidines) M2: slight preference for Zn2+ over Mg2+ (only 1 histidine) M3: less specific but Mg2+ is essential for the stability
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TESTE DEIN WISSEN
ketose visualization after TLC
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TESTE DEIN WISSEN
incubation with urea and hydrochloric acid at 100°C
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V max
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TESTE DEIN WISSEN
maximum velocity at saturating substrate concentration
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Ampholytes
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amphoteric molecules with acidic and basic groups, forming and buffering a pH gradient in an electric field used for isoelectric focussing
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Km
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substrate concentration at half maximum velocity
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Q:
enzyme activity U
A:
μmol substrate conversion/ min amount of product formed within a certain time is proportional to the enzyme activity
Q:
alkaline phosphatase (AP)
A:
homodimeric metalloenzyme (needs Zn2+ and Mg2+) stabilized by zinc ions (function can be abolished by the removal of zinc ions) magnesium does not activate AP but increases its activity (cofactor) catalyzes the hydrolysis of phosphate monoesters to form inorganic phosphate and alcohol must be kept on ice at all times! 140,000 Da
Q:
specific enzyme activity
A:
U/mg protein
Q:
formula for calculation of protein concentration (Warburg christian method)
A:
c [mg/ml]= (1,55 * E 280 ) –(0,76 * E 260 )
Q:
3 forms of coomassie brilliant blue
A:
cationic (brown), neutral (green) and anionic (blue) when protein binds, the cationic form is converted to a stable unprotonated blue form
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Q:
chelating agents
A:
...bind metal ions
Q:

glutamic acid

A:

acidic

not essential for humans
- behaves similarly to aspartic acid, and has a longer, slightly more flexible side chain

Q:
metal binding sites of E. coli AP (M1, M2, M3)
A:
M1: specific for Zn2+ (2 histidines) M2: slight preference for Zn2+ over Mg2+ (only 1 histidine) M3: less specific but Mg2+ is essential for the stability
Q:
ketose visualization after TLC
A:
incubation with urea and hydrochloric acid at 100°C
Q:
V max
A:
maximum velocity at saturating substrate concentration
Q:
Ampholytes
A:
amphoteric molecules with acidic and basic groups, forming and buffering a pH gradient in an electric field used for isoelectric focussing
Q:
Km
A:
substrate concentration at half maximum velocity
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